上越線、羽越線の各車両の所属となっている上沼垂運転区です。最後の１６５系もここの所属でした。
正式名称：ＪＲ東日本新潟支社上沼垂運転区ＪＲ東日本新潟支社新潟車両センター

常磐線（交直流車）の所属している電車区です。６５１系、Ｅ６５３系もここの所属です。
正式名称：ＪＲ東日本水戸支社勝田車両センター

埼京線と川越線（八高線）の全車を管理する電車区です。また、次世代通勤型車輌のＥ９９３系もここの所属となっています。
正式名称：ＪＲ東日本大宮支社川越電車区ＪＲ東日本大宮支社川越車両センター

東海道線の１１３系と相模線の２０５系が所属している国府津の車庫。最近はＥ２３１系の進出が激しいです…。
正式名称：ＪＲ東日本横浜支社国府津電車区ＪＲ東日本横浜支社国府津車両センター

高崎線の車両（一部宇都宮）を管轄している新前橋。２１１系が大量にいますわ。１８５系もココの所属です。元Ｍ８編成も…。
正式名称：ＪＲ東日本高崎支社新前橋電車区

京葉線の通勤車の全車のみでしたが、最近では武蔵野線の車両全車が転属してきました。臨時列車も多数入線する電車区です。
正式名称：ＪＲ東日本千葉支社京葉電車区ＪＲ東日本千葉支社京葉車両センター

東海道線の一部の車輌を管轄している東チタこと田町電車区。日中には、ブルトレなどの姿も見れて、いろんな形式を目にすることが出来ます。
正式名称：ＪＲ東日本東京支社田町電車区

青梅線、武蔵野線の全車と中央線の一部の車輌が所属している電車区です。近郊型、通勤型、特急型の３種類もの電車が集結しています。武蔵野線の車両は京葉電車区に全車転属しました。
正式名称：ＪＲ東日本八王子支社豊田電車区

南武線の全車、鶴見線全車を所属させている電車区です。最近は２０５系の動きが激しくなっています。
正式名称：ＪＲ東日本横浜支社中原電車区

横須賀・総武線や房総各線の車両を所有している幕張電車区。２５５系や１８３系といった車両もここに終結しています
ＪＲ東日本千葉支社幕張電車区

常磐線快速電車、常磐緩行線のＪＲ車両の全車の所属となっている松戸電車区。２０７系９００番台などの珍しい形式も所属しています。
正式名称：ＪＲ東日本東京支社松戸電車区ＪＲ東日本東京支社松戸車両センター

中央・篠ノ井線で活躍している特急の全車と普通列車の一部を列車を管轄しています。最近ではＥ２５７系が投入されました。
ＪＲ東日本長野支社松本電車区ＪＲ東日本長野支社松本車両センター

総武線各駅停車ならびに、東西線直通のＪＲ車輌を所属させている三鷹電車区です。最近では、習志野電車区が廃止となり、全車三鷹電車区の管轄となりました。１６９系などは廃車され、現在のＪＴの配置はありません。
正式名称：ＪＲ東日本八王子支社三鷹電車区

仙石線の全車両を管理する電車区です。現在では、独立した電車区ではなく、仙台電車区宮城野派出所となっております。東北圏唯一の直流となっています。
正式名称：ＪＲ東日本仙台支社宮城野電車区廃止

中央快速線の４＋６の分割編成は全車ここの所属となっています。すでに、電車区としては廃止され、電留線として扱われております。終電後は総武線も入区します。
正式名称：ＪＲ東日本八王子支社武蔵小金井電車区廃止

山手線の車輌は、全車ここの所属となっており、大井工場に隣設しています。ときどき、大井工場の入場車輌が疎開留置されることも。
正式名称：ＪＲ東日本東京支社山手電車区ＪＲ東日本東京支社東京車両センター